Menurut riwayat, mula-mula ada seorang kiai, kemudian datang beberapa santri memohon untuk diterima menjadi santri. Santri tersebut ingin belajar ilmu pengetahuan dari kiai tadi. Semakin hari semakin banyak santri yang datang, akhirnya tak dapat lagilah mereka tinggal di rumah kiyai itu, sehingga timbul inisiatif untuk mendirikan pondok-pondok atau kombongan atau dangau atau gubuk-gubuk di sekitar masjid dan di sekitar rumah Kyai itu tadi. Itulah asalnya sehingga dinamakan pondok.
Jadi, yang pertama kali ada adalah seorang kyai yang dengan jiwa ikhlasnya ingin mengajar, menyebarkan ilmunya serta beberapa santri yang dengan jiwa ikhlasnya ingin belajar dan menuntut ilmu dari kyai. Karena santri tadi memohon maka yang mengadakan Pondok itu ialah santri-santri sendiri. Bukan kyai yang mendirikan, bukan kyai yang membangun pondok. Yang merawat dan menjaganya juga santri-santri sendiri. Semuanya dari santri untuk santri.
